https://frosthead.com

Első gerinces fajok leírása egy DNS vonalkóddal

1982 decemberében Benjamin Victor, az Ocean Science Foundation korallzátony-kutatási kezdeményezőjének alapítója egy zátonyba merült egy Smithsonian Trópusi Kutatóintézet terepi állomásának partjainál, amikor felnőtt gobyt felkutatott. A halak kissé különböztek az atlanti gobik rokonoktól, de jellemzői nem voltak elég egyediek ahhoz, hogy új fajnak nyilvánítsák.

Victor azt gyanította, hogy a különbségek mélyen a goby genetikai felépítésében rejlenek, ám a pusztán fizikai azonosítókra, például jelölésekre, az uszonyok számára és a csontok formájára épülő faj-azonosító rendszer kudarcot vallott neki. Szüksége lenne egy második mintára és DNS-elemzésre. Tehát a minta ült, és - valójában Victor asztalán - közel 25 évig ült.

Dave Jones, a Nemzeti Tengeri Halászati ​​Szolgálatból 2006 márciusában gyűjtött egy lárva mintát, amely Victor pálcáját emlékeztette egy mexikói Yucatan csapdájába. Innentől kezdve a vonalkódolás új taxonómiai technikája lehetővé tette Victor számára, hogy a lárva DNS-ével egyezzen a felnőtt DNS-ével, és új gombakészüléssé nyilvánítsa a gobyt, amely 25 százalékkal eltér az atlanti gobij rokonától (ne feledje: emberek és a csimpánzok csak 1-2 százalékban különböznek egymástól).

A hal állítólagos hírneve az, hogy identitását egy DNS vonalkód szűkítette. A vonalkód, a genomban egy egyeztetett helyről származik, úgy működik, mint egy fogyasztási cikk vonalkódja, mivel az azonosítást tekintve lezárja az üzletet.

Coryphopterus kuna elnevezésű goby lett az első gerinces faj, amelynek DNS vonalkódja szerepel a hivatalos fajleírásban. Körülbelül 30 000 ismert fajt, a gombától a madarakig, vonalkóddal láttak el, de a fajokat minden esetben megtalálták és tudományosan leírták a vonalkódok létrehozása előtt. Az Élet vonalkód kezdeményezés, amelynek a Smithsonian Intézet partnere, sürgeti a rövid DNS-szálak összegyűjtését és egy nyílt hozzáférésű adatbázisba történő beillesztését.

"Nem volt mód arra, hogy a halak azonosítását könnyűvé és következetessé tegyük. Általában szakértőnek kellett lennie, és jó felnőtt példánynak kellett lennie a vizsgálathoz, és akkor ez volt az ön véleménye" - mondja Victor a taxonómia előzetes vonalkódolásához. "Most bárki, aki hozzáfér a vonalkódoló technológiához, biztosan azt mondhatja, hogy a szekvencia megegyezik az X fajjal, még akkor is, ha van egy tojás, lárva vagy egy méretarány vagy bőrdarab."

(Az STRI jóvoltából)

Első gerinces fajok leírása egy DNS vonalkóddal