A Ginkgo Bioworks hackerekkel foglalkozik. Bár inkább azt mondják, hogy "tervező szervezeteket" mutatnak, az alkalmazottak laboratóriumot építettek, vagy "öntödei" Bostonban, ahol csapkodtak a biológiára. Elosztják a géneket, majd gének keverékeit illesztik az élesztő fiolákba, hogy gyorsan növekedjenek az emberi szükségleteket kiszolgáló szintetikus szervezetek .
A Gingko kreatív igazgatója, Christina Agapakis azt mondja, hogy alapvetõen az evolúció felgyorsítása. "Olyan, mint egy gyors prototípusgyár" - mondja.
A biohackerek építő organizmusokon dolgoznak, amelyek szén-dioxid-megkötést végeznek, és más olyan probiotikumokat termelő szervezeteken, amelyek segítenek az embereknek a fertőzések leküzdésében. A vállalat kezdeti támogatást kapott a DARPA-tól az utóbbi fejlesztésére. De jelenleg a Gingko olyan organizmusokat hoz létre, amelyek specifikus szagokat bocsátanak ki. A cél szintetikus illatok és aromák tömeggyártása, amelyek mindent felhasználhatók, a parfümtől a mesterséges édesítőig. Ez egy lépés a ritka, drága, lassan növekvő vagy illékony szerves vegyületek helyettesítésére. A Robertet, egy francia illatgyártó cég megbízást adott a Gingkóval, hogy segítsen előállítani egy specifikus, csak Törökországban és Bulgáriában termesztett rózsa illatát, amelyet fárasztóan szednek kézzel.
"Az illatanyag vezető szerepet tölt be, mert az illatanyag valami olyan vegyi anyagát használja, amely biológiai kivonatként kezdődött" - mondja. "Tehát azt vizsgáljuk, hogy a biológia miként térhet vissza a vegyiparhoz, és fenntarthatóvá és megújíthatóvá teszi azt."
Nemrég beszélték Agapakissal a társaságról és küldetéséről:
Hogyan kezdte el Ginkgo?
A Ginkgot 2008-ban alapította Tom Knight és négy srác (Reshma Shetty, Jason Kelly, Barry Canton, Austin Ch), akik éppen befejezték a PhD-k megszerzését a MIT-be. Tomnak keze volt az ARPANET, az Internet előfutára fejlesztésében, de a 90-es évek végén úgy döntött, hogy unalmas a számítógépek, és a biológia programozása érdekes. Meg akarta látni, hogy a mérnöki és a biológia hol keresztezheti egymást. Ez volt Ginkgo pontja. Az alapítók megkönnyítik a biológia mérnöki tervezését, majd megvizsgálják, hogy ez mit jelent az ipar és a technológia számára.
Miért történik most?
Amikor 2008-ban kezdték el, éppen akkor jött az ideje, amikor a DNS-szekvenciák költségei gyorsan csökkentek, és emiatt az emberek mindent elkezdenek szekvenálni. Az ismeretek, hogy az evolúció hogyan oldotta meg a problémákat, gyorsan elterjedtek, és az emberek mindenféle genomot és enzimet szekvenáltak. Erőforrássá vagy könyvtárrá vált.
A dolgok másik oldala a szintézis. Korábban kellett megtalálnia az organizmusokat, és most szintetizálhatja a géneket az adatbázisból. Amikor hallgató voltam, akkor 1 dollárba került bázispáronként, tehát egy gén 5000 dollárba kerül. Most már bérenkénti pennyre esett vissza. Éppen most készítettünk 100 millió bázispárt a Twist-től (egy szintetikus DNS-társaságtól), ami elegendő az élesztő genom tízszer írásához. Sokkal több lehetséges.
Christina Agapakis, a Ginkgo Bioworks kreatív igazgatója (Fotó: Thatcher Cook, a PopTech számára) Pontosan mit csinálsz a laborban?
Olyan, mint egy gyors prototípusgyár. Sokféle változatot futtathatunk a különböző utakról, és megnézhetjük, mi működik a megfelelő kombinációban.
Időnként projektjeink az ügyfelekkel kezdődnek. Azt fogják mondani: „Nehezen állíthatjuk elő ezt az összetevőt”, és elkezdenénk keresni egy olyan szervezetet, amely valamit előállít számukra. A biokémiától kezdjük. Van olyan mérnökök, akik megértik a sejtek biológiáját és az összes metabolitot, amelyek ott vannak, tehát megértik, hogy a folyamatok hogyan befolyásolják a sejteket.
Más típusú projektek azt vizsgálják, hogy a biológia mit tehet a kémiai térben. [Itt van Ginkgo növekvő mikrobák, hogy utánozzák a nehezen növekvő rózsa illatát.] Azoknak az összetevőknek, amelyeket jelenleg vizsgálunk, vagy általában a virágok vagy növények számára, számos olyan vegyi anyagcsoport létezik, amelyek különböző sejteket képesek előállítani. Jelenleg 1000 és 5000 különféle enzim létezik. Azt fogjuk mondani, hogy szintetizálhatjuk őket, élesztõbe tehetjük és megnézhetjük, mit tesznek a variánsok.
Miért használ élesztőt alapanyagként?
Az élesztő félelmetes, mert mi, mint emberek, igazán jók vagyunk az élesztő erjesztésében. Az élesztőnek az a képessége, hogy aromákat és illatokat hozzon létre a sör miatt, nagyon sok technológiával rendelkezik. Amit mi csinálunk, a kortárs tudomány és a hagyományos sörfőzési módszerek igazán hűvös keveréke. Erjesztési vezetőnk valójában egy sörgyárral rendelkezik - a misztikus sörfőzde Chelsea-ban [Massachusetts].
Az öntöde előnye, hogy képes automatizálni a szekvenálást. (Ginkgo Bioworks) Most dolgozol?
Van egy folyamatosan fejlődő Venn-diagram, ahol a biológia képességei rejlenek, ahol a mérnöki megoldások megvalósíthatók, és ahol van ipar, szükséglet és technológia. Az illatanyag vezető szerepet tölt be, de a szén-dioxid-leválasztás technológiáján is dolgozunk. Megkaptuk az Advanced Research Projects Agency Energy (ARPA-E) támogatást a szén-dioxid-leválasztás és a rövid szénláncú szénatomok összetettebb dolgokká történő átalakításának vizsgálatához. Együtt dolgozunk az Ajinomoto-val, egy japán élelmiszer- és vegyipari társasággal, hogy megtudjuk, hogyan lehetne javítani a hulladékáramot.
Mi történik ezután?
A kibővített öntöde Bioworks 2 jövő év tavaszán vagy nyár elején nyílik meg, és az öntöde folyamatosan iterál. Mindig gondolkodunk a szervezettervezésen és annak hatékonyabb működtetésén. Új projekteket, ügyfeleket és piacokat hozunk létre, de a technológián is dolgozunk.
Tíz év elteltével vizsgáljuk a mikrobiómot, a mikrobiális közösségeket és azt, hogy miként tudjuk megtervezni a mikrobákat. Várakozással tekintek egy olyan időszakra, amikor tudjuk, hogyan működnek együtt a mikrobák. Gondolkodunk az összes illatra is. Egyszer azt akarjuk, hogy legyen valami, amelyet "100 üvegnek" hívnak. 100 különböző illat lenne a természet által létrehozott.
